羊肚菌杂菌主要分为以下几种：
细菌：包括枯草杆菌粘液变种、蜡状芽孢杆菌粘液变种等，这些细菌繁殖迅速，会产生异味并使菌丝酸败。
放线菌：以链霉菌为主，包括白色链霉菌、湿链霉菌等，它们会在培养基中或表面形成白色粉状斑点，产生土腥味，导致羊肚菌菌丝不长或消失。
酵母菌：包括红酵母、橙色红酵母、黑酵母等，这些酵母菌对羊肚菌的菌丝体危害很大，可能导致菌丝不长或死亡。
霉菌：羊肚菌的菌丝最容易受到霉菌的危害，常见的霉菌有白边青霉、白青霉、木霉等，它们会侵害羊肚菌的菌丝体，导致菌丝死亡或产量下降。
除了以上四种杂菌外，还可能存在其他杂菌，如小杆线虫、菇蚊、螨类等，它们也会对羊肚菌的生长和产量造成一定的影响。
为了防治这些杂菌，可以采取一系列措施，如选择适当的培养基配方、控制培养基的pH值、保持适宜的温度和湿度、加强通风换气、使用生物防治剂等。同时，定期检查菌丝的生长情况，及时发现并处理杂菌污染，也是保证羊肚菌产量和质量的重要措施之一。
以下是一些保存羊肚菌根的方法：
1.干燥保存：将羊肚菌根放在通风良好的地方晾干，避免阳光直射。干燥后的羊肚菌根可以放在密封的容器中，并存放在干燥、阴凉的地方。
2.低温保存：可以将羊肚菌根放入冰箱冷藏保存，但要注意避免受潮。
3.真空包装：将羊肚菌根进行真空包装，可延长保存时间。
4.避免潮湿：羊肚菌根应保存在干燥的环境中，潮湿可能导致发霉。
5.防虫处理：可采取适当的防虫措施，防止虫害。
6.定期检查：定期检查保存的羊肚菌根，确保其没有出现变质、发霉等情况。
在保存羊肚菌根时，需要注意以下几点：
7.确保羊肚菌根完全干燥，避免残留水分。
8.保存容器要密封良好，防止空气进入。
9.避免与其他异味物品放在一起，以免影响口感。
10.按照正确的方法保存，以确保其品质和口感。