子囊菌不一定有毒。虽然某些子囊菌可以产生毒性物质，但大部分子囊菌都是无害的或者对人体无害的。此外，子囊菌既有益处也有害处，一些子囊菌可以产生有用的药物或食品，例如面包、啤酒和蘑菇，另一些则会在农作物上造成损害。因此，在处理或食用子囊菌时，应该注意通过科学方法进行识别和分类，以避免不必要的风险。
子囊菌并不完全有毒，事实上，只有少数子囊菌种类会对人体产生毒性反应。例如，铜铲锈菌和麦角菌就可以产生强烈毒性。但大多数子囊菌主要是在食物腐败和土壤中发挥作用，对人类卫生和健康没有任何影响。此外，子囊菌在制造药物、食品和其它化学工业产品方面也有广泛的应用。因此，总的来说，子囊菌并不是一个有害的微生物，而是一个非常重要的生物类别，具有广泛的应用和研究价值。