中山公司1039市场采购的报关流程如下：

在国家试点地区内注册一家外贸商户，并进行市场采购贸易联网信息平台的备案。

在大陆银行开通自己独立的美金收款账户。

使用服务商协助进行报关，收结汇，完税等一系列服务。

美金货款可以直接收到香港账户，然后转回国内美金账户用来结汇成人民币。

人民币可以直接付款给各个供应商，也可以直接转到法人的私人账户。

报关时使用个体户抬头来报关，用自己的报关单来核销已经收到的美金外汇。

进行个人所得税的完税缴纳。由于市场采购贸易是国家出台的贸易政策，免征免退，不征收增值税，也不退税。

请注意，具体的报关流程可能因地区、商品类型和具体要求而有所不同。因此，中山公司在执行1039市场采购报关流程时，应详细了解和遵守当地的海关规定和政策，确保所有操作合法合规。如有需要，建议咨询专业的报关公司或当地海关部门以获取更准确的信息和指导。